当前，中小企业在我国的国民经济中已经发挥着越来越重要的作用，是我国国民经济的重要组成部分。不但给我国的现代化建设创造了巨大的财富，同时，也解决了大量的劳动力就业问题。但是，在中小企业快速发展的同时，很多内部管理问题也逐渐显现出来，对企业的长期稳定发展不利。
因此，我国的中小企业，要想在激烈的市场竞争中立于不败之地，转变企业不合理的管理制度，规范企业不严谨的业务流程，已经成为中小企业发展的必由之路。在中小企业管理的改革和发展过程中，ERP流程管理系统在企业改变传统管理思想的过程中起着重要的作用。
中小企业目前在管理上存在的问题主要有：
流程管理方面
我国的很多中小企业没有清晰明确的业务流程、部门间的权责不明确。不同部门之间的信息传递靠纸质单据或者口头传达，一旦出了问题便相互推诿。由于没有明确的销售和生产流程，往往销售部门的订单不准确，从而导致生产部门和采购部门经常变动生产订单和采购订单，每天生产的都是临时任务或者紧急订单，整个企业处于被动的生产状态。
同时，企业在管理中缺乏对流程的有效沟通。企业在创立初期，一共才十几个人，不用沟通大家的目标和想法也很一致。当企业得到迅速的扩展，人员激增，流程也开始变得复杂，此时需要的不仅是严格管理，更需要制定规范合理的流程。只有科学合理的流程才能有效解决企业在发展过程中存在的管理混乱问题。
财务管理方面
大部分中小企业的财务管理仅仅局限于财务记账阶段，没有相应的财务核算和财务分析，不能对企业高层的决策起到关键作用。企业虽然成立了专门的财务机构，配备了专业会计人员，但他们在企业管理中所发挥的作用甚微，财务工作基本上只限于会计计算而不是会计核算，因为财务人员的日常工作中没有涉及到对经济业务的审核部分。
财务对现金管理也不够科学，往往造成资金闲置或不足。有些中小企业认为现金越多越好，造成现金闲置，未参加生产周转;有些企业的资金使用缺少计划安排，过量购置不动产，无法应付经营急需的资金，陷入财务困境。同时，由于没有建立严格的收付款条款，缺乏有力的催收措施，应收账款不能及时兑现或形成呆账，导致应收账款周转缓慢，造成资金回收困难。
库存管理方面
由于中小企业信息化程度不高，大部分企业的库存统计数据都是通过电子表格实现，统计员往往晚上或者早上将汇总的库存数据录入电子表格，这种统计方式缺乏及时性和数据准确性。采购部门和销售部门由于不能掌握实时准确的库存，会影响订单的下达，同时不利于领导者实时监控企业的运营状况。
由于库存统计数据不准确，不能真实反映库存，导致库存积压，库存量不断增大，盘点困难。财务没有严格的存货管理制度，最终导致库存占用资金过大，影响企业资金周转。同时，由于很多存储的材料和产品有保质期，库存量大的物资经常发生变质的情况。因此，库存数据不准确和库存量大给企业造成很大的经济损失。
企业的“一把手”管理模式
中小企业典型的管理模式是所有权与经营权的高度统一，企业的投资者同时就是经营者，老板个人的命运代表着整个企业的命运，老板的成败直接决定企业的兴衰。企业领导者不能合理将权利下放。有一些企业领导总觉得部属不如自己，生怕部属办不好事，凡事亲力亲为，投入过多精力在具体事务中，无暇顾及企业的经营分析和流程规划;有一些领导虽然把工作交给部属，却不能完全放心，设置了很多审批程序，导致业务流程不畅。
企业一把手不能将权利下放的行为，会打消员工的工作积极性，不利于企业的长远发展。很多中小企业的员工整日工作在不满的情绪中，缺乏创造力和工作激情，最终导致企业人才流失和经营业绩下滑。企业的领导者应该站在管理的高度，把握全局，使企业步入快速健康发展的行列。
以上问题不但制约着企业的发展，严重的会导致企业陷入危险境地。因此，中小企业迫切需要解决管理中存在的问题。